Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPAQ15257 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PTPAQ15257 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
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