Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KARSQ15046 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KARSQ15046 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KARSQ15046 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KARSQ15046 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KARSQ15046 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
KARSQ15046 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KARSQ15046 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KARSQ15046 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KARSQ15046 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KARSQ15046 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KARSQ15046 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KARSQ15046 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KARSQ15046 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KARSQ15046 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KARSQ15046 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KARSQ15046 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KARSQ15046 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KARSQ15046 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KARSQ15046 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KARSQ15046 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KARSQ15046 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KARSQ15046 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KARSQ15046 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KARSQ15046 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KARSQ15046 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KARSQ15046 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KARSQ15046 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KARSQ15046 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KARSQ15046 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KARSQ15046 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KARSQ15046 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KARSQ15046 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KARSQ15046 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KARSQ15046 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KARSQ15046 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KARSQ15046 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KARSQ15046 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
KARSQ15046 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KARSQ15046 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KARSQ15046 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KARSQ15046 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KARSQ15046 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KARSQ15046 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KARSQ15046 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KARSQ15046 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KARSQ15046 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KARSQ15046 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KARSQ15046 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KARSQ15046 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KARSQ15046 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KARSQ15046 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KARSQ15046 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KARSQ15046 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KARSQ15046 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KARSQ15046 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KARSQ15046 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KARSQ15046 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KARSQ15046 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KARSQ15046 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KARSQ15046 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KARSQ15046 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KARSQ15046 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KARSQ15046 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KARSQ15046 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KARSQ15046 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KARSQ15046 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KARSQ15046 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KARSQ15046 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KARSQ15046 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KARSQ15046 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KARSQ15046 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KARSQ15046 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KARSQ15046 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KARSQ15046 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KARSQ15046 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KARSQ15046 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KARSQ15046 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KARSQ15046 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KARSQ15046 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KARSQ15046 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KARSQ15046 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KARSQ15046 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KARSQ15046 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KARSQ15046 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KARSQ15046 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KARSQ15046 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KARSQ15046 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KARSQ15046 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KARSQ15046 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KARSQ15046 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KARSQ15046 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KARSQ15046 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KARSQ15046 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KARSQ15046 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KARSQ15046 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KARSQ15046 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KARSQ15046 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KARSQ15046 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KARSQ15046 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
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