Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PSME4Q14997 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSME4Q14997 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms