Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MKRN3Q13064 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MKRN3Q13064 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MKRN3Q13064 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MKRN3Q13064 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MKRN3Q13064 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MKRN3Q13064 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MKRN3Q13064 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MKRN3Q13064 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MKRN3Q13064 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MKRN3Q13064 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MKRN3Q13064 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MKRN3Q13064 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MKRN3Q13064 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MKRN3Q13064 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MKRN3Q13064 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MKRN3Q13064 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MKRN3Q13064 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MKRN3Q13064 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MKRN3Q13064 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MKRN3Q13064 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MKRN3Q13064 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
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