Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG3AQ06141 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms