Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RHBDL3P58872 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RHBDL3P58872 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RHBDL3P58872 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RHBDL3P58872 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms