Protein–RNA interactions for Protein: P52435

POLR2J, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2JP52435 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2JP52435 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms