Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB5CP51148 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB5CP51148 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1777.5 ms