Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRP3P50461 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSRP3P50461 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms