Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABIFP47224 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABIFP47224 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABIFP47224 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABIFP47224 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABIFP47224 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABIFP47224 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABIFP47224 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABIFP47224 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABIFP47224 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABIFP47224 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RABIFP47224 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RABIFP47224 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RABIFP47224 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABIFP47224 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABIFP47224 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABIFP47224 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABIFP47224 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABIFP47224 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABIFP47224 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABIFP47224 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABIFP47224 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABIFP47224 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABIFP47224 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABIFP47224 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABIFP47224 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABIFP47224 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABIFP47224 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABIFP47224 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABIFP47224 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABIFP47224 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABIFP47224 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABIFP47224 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABIFP47224 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABIFP47224 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABIFP47224 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABIFP47224 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABIFP47224 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABIFP47224 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABIFP47224 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABIFP47224 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABIFP47224 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABIFP47224 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABIFP47224 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABIFP47224 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABIFP47224 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABIFP47224 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABIFP47224 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABIFP47224 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABIFP47224 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABIFP47224 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABIFP47224 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RABIFP47224 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABIFP47224 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RABIFP47224 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABIFP47224 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABIFP47224 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABIFP47224 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABIFP47224 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABIFP47224 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABIFP47224 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABIFP47224 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABIFP47224 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABIFP47224 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RABIFP47224 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABIFP47224 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABIFP47224 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABIFP47224 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABIFP47224 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABIFP47224 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABIFP47224 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABIFP47224 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABIFP47224 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABIFP47224 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABIFP47224 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABIFP47224 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABIFP47224 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABIFP47224 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABIFP47224 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABIFP47224 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABIFP47224 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABIFP47224 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABIFP47224 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABIFP47224 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABIFP47224 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RABIFP47224 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABIFP47224 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABIFP47224 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABIFP47224 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RABIFP47224 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RABIFP47224 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RABIFP47224 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABIFP47224 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABIFP47224 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABIFP47224 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABIFP47224 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABIFP47224 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABIFP47224 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABIFP47224 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RABIFP47224 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms