Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR4P46093 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR4P46093 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR4P46093 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR4P46093 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR4P46093 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR4P46093 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR4P46093 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR4P46093 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR4P46093 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR4P46093 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR4P46093 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR4P46093 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR4P46093 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR4P46093 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR4P46093 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR4P46093 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR4P46093 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR4P46093 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR4P46093 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR4P46093 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR4P46093 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR4P46093 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR4P46093 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR4P46093 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR4P46093 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR4P46093 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR4P46093 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR4P46093 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR4P46093 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR4P46093 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR4P46093 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR4P46093 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR4P46093 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPR4P46093 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPR4P46093 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPR4P46093 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPR4P46093 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPR4P46093 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPR4P46093 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPR4P46093 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPR4P46093 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPR4P46093 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPR4P46093 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR4P46093 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR4P46093 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR4P46093 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR4P46093 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR4P46093 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR4P46093 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR4P46093 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR4P46093 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPR4P46093 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPR4P46093 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPR4P46093 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPR4P46093 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPR4P46093 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPR4P46093 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPR4P46093 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPR4P46093 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPR4P46093 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPR4P46093 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPR4P46093 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPR4P46093 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPR4P46093 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPR4P46093 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPR4P46093 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GPR4P46093 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GPR4P46093 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR4P46093 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR4P46093 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR4P46093 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR4P46093 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR4P46093 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR4P46093 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR4P46093 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR4P46093 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPR4P46093 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPR4P46093 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPR4P46093 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPR4P46093 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPR4P46093 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPR4P46093 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR4P46093 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR4P46093 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR4P46093 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR4P46093 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR4P46093 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR4P46093 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR4P46093 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR4P46093 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR4P46093 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR4P46093 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR4P46093 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GPR4P46093 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPR4P46093 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPR4P46093 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPR4P46093 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPR4P46093 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPR4P46093 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms