Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4A3P38919 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EIF4A3P38919 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms