Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
FLT4P35916 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FLT4P35916 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FLT4P35916 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FLT4P35916 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FLT4P35916 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FLT4P35916 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
FLT4P35916 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FLT4P35916 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
FLT4P35916 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
FLT4P35916 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FLT4P35916 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FLT4P35916 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
FLT4P35916 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FLT4P35916 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FLT4P35916 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FLT4P35916 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FLT4P35916 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FLT4P35916 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FLT4P35916 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FLT4P35916 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.77
FLT4P35916 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.77
FLT4P35916 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
FLT4P35916 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FLT4P35916 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FLT4P35916 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FLT4P35916 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
FLT4P35916 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FLT4P35916 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FLT4P35916 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FLT4P35916 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
FLT4P35916 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
FLT4P35916 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FLT4P35916 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
FLT4P35916 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
FLT4P35916 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FLT4P35916 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FLT4P35916 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FLT4P35916 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FLT4P35916 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
FLT4P35916 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FLT4P35916 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FLT4P35916 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
FLT4P35916 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FLT4P35916 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FLT4P35916 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
FLT4P35916 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
FLT4P35916 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
FLT4P35916 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FLT4P35916 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
FLT4P35916 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FLT4P35916 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FLT4P35916 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FLT4P35916 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FLT4P35916 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FLT4P35916 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FLT4P35916 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
FLT4P35916 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FLT4P35916 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
FLT4P35916 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
FLT4P35916 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
FLT4P35916 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
FLT4P35916 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FLT4P35916 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FLT4P35916 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FLT4P35916 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FLT4P35916 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FLT4P35916 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FLT4P35916 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FLT4P35916 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FLT4P35916 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
FLT4P35916 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
FLT4P35916 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
FLT4P35916 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
FLT4P35916 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FLT4P35916 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
FLT4P35916 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FLT4P35916 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FLT4P35916 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FLT4P35916 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
FLT4P35916 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
FLT4P35916 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
FLT4P35916 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
FLT4P35916 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
FLT4P35916 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FLT4P35916 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FLT4P35916 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FLT4P35916 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FLT4P35916 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FLT4P35916 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FLT4P35916 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FLT4P35916 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FLT4P35916 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FLT4P35916 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FLT4P35916 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FLT4P35916 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FLT4P35916 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FLT4P35916 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FLT4P35916 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FLT4P35916 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms