Protein–RNA interactions for Protein: P31321

PRKAR1B, cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1BP31321 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAR1BP31321 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAR1BP31321 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAR1BP31321 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAR1BP31321 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAR1BP31321 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAR1BP31321 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAR1BP31321 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAR1BP31321 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms