Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP1P29466 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP1P29466 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP1P29466 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP1P29466 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP1P29466 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP1P29466 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP1P29466 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP1P29466 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP1P29466 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP1P29466 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP1P29466 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASP1P29466 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASP1P29466 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP1P29466 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP1P29466 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP1P29466 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP1P29466 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP1P29466 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP1P29466 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP1P29466 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP1P29466 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP1P29466 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP1P29466 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP1P29466 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP1P29466 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP1P29466 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP1P29466 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP1P29466 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP1P29466 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP1P29466 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP1P29466 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP1P29466 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP1P29466 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP1P29466 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP1P29466 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP1P29466 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP1P29466 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP1P29466 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP1P29466 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP1P29466 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP1P29466 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP1P29466 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CASP1P29466 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP1P29466 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP1P29466 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP1P29466 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP1P29466 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP1P29466 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP1P29466 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP1P29466 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP1P29466 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP1P29466 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP1P29466 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP1P29466 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP1P29466 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP1P29466 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP1P29466 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP1P29466 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP1P29466 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP1P29466 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP1P29466 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP1P29466 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP1P29466 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP1P29466 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP1P29466 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP1P29466 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP1P29466 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP1P29466 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP1P29466 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP1P29466 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP1P29466 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP1P29466 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP1P29466 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP1P29466 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP1P29466 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP1P29466 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP1P29466 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP1P29466 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP1P29466 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP1P29466 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP1P29466 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP1P29466 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP1P29466 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP1P29466 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP1P29466 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP1P29466 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP1P29466 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP1P29466 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP1P29466 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP1P29466 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP1P29466 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP1P29466 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP1P29466 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP1P29466 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP1P29466 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP1P29466 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP1P29466 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP1P29466 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP1P29466 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms