Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HMGA1P17096 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGA1P17096 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGA1P17096 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms