Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPA1P15085 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPA1P15085 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPA1P15085 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPA1P15085 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPA1P15085 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPA1P15085 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPA1P15085 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPA1P15085 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPA1P15085 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPA1P15085 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPA1P15085 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPA1P15085 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CPA1P15085 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CPA1P15085 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPA1P15085 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPA1P15085 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPA1P15085 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPA1P15085 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPA1P15085 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPA1P15085 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPA1P15085 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPA1P15085 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPA1P15085 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPA1P15085 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPA1P15085 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPA1P15085 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPA1P15085 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPA1P15085 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPA1P15085 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPA1P15085 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CPA1P15085 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPA1P15085 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPA1P15085 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CPA1P15085 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPA1P15085 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPA1P15085 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPA1P15085 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPA1P15085 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPA1P15085 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CPA1P15085 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPA1P15085 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPA1P15085 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPA1P15085 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CPA1P15085 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CPA1P15085 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CPA1P15085 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CPA1P15085 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CPA1P15085 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CPA1P15085 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CPA1P15085 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPA1P15085 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPA1P15085 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPA1P15085 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPA1P15085 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPA1P15085 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPA1P15085 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPA1P15085 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPA1P15085 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPA1P15085 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPA1P15085 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPA1P15085 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPA1P15085 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPA1P15085 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPA1P15085 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPA1P15085 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPA1P15085 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPA1P15085 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPA1P15085 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPA1P15085 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPA1P15085 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPA1P15085 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPA1P15085 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPA1P15085 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPA1P15085 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPA1P15085 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPA1P15085 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPA1P15085 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPA1P15085 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPA1P15085 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPA1P15085 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPA1P15085 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPA1P15085 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPA1P15085 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CPA1P15085 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPA1P15085 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPA1P15085 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPA1P15085 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPA1P15085 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPA1P15085 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPA1P15085 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPA1P15085 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPA1P15085 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPA1P15085 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPA1P15085 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPA1P15085 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPA1P15085 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPA1P15085 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPA1P15085 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPA1P15085 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 536 ms