Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LYL1P12980 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LYL1P12980 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LYL1P12980 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LYL1P12980 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LYL1P12980 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LYL1P12980 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LYL1P12980 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LYL1P12980 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LYL1P12980 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LYL1P12980 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LYL1P12980 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LYL1P12980 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LYL1P12980 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LYL1P12980 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LYL1P12980 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LYL1P12980 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LYL1P12980 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LYL1P12980 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LYL1P12980 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LYL1P12980 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LYL1P12980 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LYL1P12980 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LYL1P12980 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LYL1P12980 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LYL1P12980 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LYL1P12980 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LYL1P12980 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LYL1P12980 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LYL1P12980 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LYL1P12980 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LYL1P12980 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LYL1P12980 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LYL1P12980 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LYL1P12980 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LYL1P12980 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LYL1P12980 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LYL1P12980 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LYL1P12980 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LYL1P12980 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LYL1P12980 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LYL1P12980 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LYL1P12980 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LYL1P12980 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LYL1P12980 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LYL1P12980 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LYL1P12980 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LYL1P12980 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LYL1P12980 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LYL1P12980 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LYL1P12980 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LYL1P12980 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LYL1P12980 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LYL1P12980 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LYL1P12980 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LYL1P12980 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LYL1P12980 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LYL1P12980 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LYL1P12980 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LYL1P12980 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LYL1P12980 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LYL1P12980 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LYL1P12980 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LYL1P12980 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LYL1P12980 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LYL1P12980 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LYL1P12980 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LYL1P12980 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LYL1P12980 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LYL1P12980 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LYL1P12980 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LYL1P12980 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LYL1P12980 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LYL1P12980 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LYL1P12980 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LYL1P12980 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LYL1P12980 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LYL1P12980 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LYL1P12980 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LYL1P12980 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LYL1P12980 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LYL1P12980 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LYL1P12980 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LYL1P12980 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LYL1P12980 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LYL1P12980 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LYL1P12980 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LYL1P12980 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LYL1P12980 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LYL1P12980 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LYL1P12980 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LYL1P12980 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LYL1P12980 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LYL1P12980 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LYL1P12980 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LYL1P12980 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LYL1P12980 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LYL1P12980 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LYL1P12980 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LYL1P12980 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms