Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAMP11215 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAMP11215 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms