Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOEP02649 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOEP02649 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOEP02649 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOEP02649 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOEP02649 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOEP02649 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOEP02649 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOEP02649 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOEP02649 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOEP02649 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOEP02649 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOEP02649 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOEP02649 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOEP02649 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOEP02649 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
APOEP02649 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOEP02649 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOEP02649 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOEP02649 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOEP02649 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
APOEP02649 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
APOEP02649 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
APOEP02649 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOEP02649 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOEP02649 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOEP02649 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
APOEP02649 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
APOEP02649 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOEP02649 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOEP02649 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
APOEP02649 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOEP02649 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOEP02649 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOEP02649 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOEP02649 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOEP02649 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOEP02649 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOEP02649 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOEP02649 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOEP02649 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
APOEP02649 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOEP02649 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOEP02649 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOEP02649 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOEP02649 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOEP02649 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOEP02649 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
APOEP02649 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOEP02649 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
APOEP02649 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOEP02649 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOEP02649 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOEP02649 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOEP02649 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOEP02649 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOEP02649 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOEP02649 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOEP02649 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOEP02649 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOEP02649 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOEP02649 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOEP02649 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOEP02649 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOEP02649 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOEP02649 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOEP02649 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOEP02649 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APOEP02649 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APOEP02649 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOEP02649 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOEP02649 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOEP02649 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOEP02649 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOEP02649 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOEP02649 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOEP02649 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOEP02649 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOEP02649 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOEP02649 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOEP02649 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOEP02649 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOEP02649 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOEP02649 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOEP02649 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOEP02649 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOEP02649 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOEP02649 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOEP02649 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
APOEP02649 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOEP02649 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
APOEP02649 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOEP02649 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOEP02649 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOEP02649 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOEP02649 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
APOEP02649 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOEP02649 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOEP02649 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOEP02649 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms