Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAPBO95292 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAPBO95292 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAPBO95292 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VAPBO95292 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAPBO95292 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAPBO95292 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAPBO95292 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAPBO95292 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAPBO95292 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAPBO95292 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAPBO95292 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAPBO95292 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAPBO95292 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAPBO95292 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAPBO95292 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAPBO95292 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VAPBO95292 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAPBO95292 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAPBO95292 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAPBO95292 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAPBO95292 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAPBO95292 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAPBO95292 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAPBO95292 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAPBO95292 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAPBO95292 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAPBO95292 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAPBO95292 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAPBO95292 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAPBO95292 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAPBO95292 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAPBO95292 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAPBO95292 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAPBO95292 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAPBO95292 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VAPBO95292 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VAPBO95292 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAPBO95292 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAPBO95292 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAPBO95292 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAPBO95292 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAPBO95292 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAPBO95292 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAPBO95292 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAPBO95292 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAPBO95292 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAPBO95292 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAPBO95292 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAPBO95292 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAPBO95292 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAPBO95292 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAPBO95292 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAPBO95292 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VAPBO95292 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAPBO95292 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAPBO95292 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAPBO95292 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAPBO95292 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAPBO95292 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAPBO95292 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAPBO95292 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAPBO95292 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAPBO95292 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAPBO95292 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAPBO95292 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAPBO95292 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAPBO95292 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAPBO95292 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAPBO95292 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAPBO95292 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAPBO95292 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAPBO95292 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAPBO95292 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAPBO95292 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAPBO95292 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAPBO95292 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAPBO95292 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAPBO95292 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAPBO95292 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAPBO95292 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAPBO95292 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
VAPBO95292 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAPBO95292 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAPBO95292 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAPBO95292 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAPBO95292 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VAPBO95292 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAPBO95292 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VAPBO95292 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAPBO95292 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAPBO95292 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAPBO95292 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAPBO95292 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VAPBO95292 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAPBO95292 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAPBO95292 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAPBO95292 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VAPBO95292 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAPBO95292 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms