Protein–RNA interactions for Protein: O75792

RNASEH2A, Ribonuclease H2 subunit A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEH2AO75792 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNASEH2AO75792 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNASEH2AO75792 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNASEH2AO75792 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNASEH2AO75792 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNASEH2AO75792 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNASEH2AO75792 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RNASEH2AO75792 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNASEH2AO75792 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNASEH2AO75792 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNASEH2AO75792 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNASEH2AO75792 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNASEH2AO75792 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNASEH2AO75792 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNASEH2AO75792 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNASEH2AO75792 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RNASEH2AO75792 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms