Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC22O60826 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC22O60826 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms