Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBX1O43435 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TBX1O43435 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TBX1O43435 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TBX1O43435 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TBX1O43435 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TBX1O43435 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TBX1O43435 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TBX1O43435 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TBX1O43435 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TBX1O43435 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TBX1O43435 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TBX1O43435 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TBX1O43435 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBX1O43435 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBX1O43435 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBX1O43435 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBX1O43435 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBX1O43435 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBX1O43435 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBX1O43435 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBX1O43435 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBX1O43435 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBX1O43435 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBX1O43435 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBX1O43435 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBX1O43435 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBX1O43435 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBX1O43435 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBX1O43435 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBX1O43435 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TBX1O43435 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TBX1O43435 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBX1O43435 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBX1O43435 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBX1O43435 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBX1O43435 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBX1O43435 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBX1O43435 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBX1O43435 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBX1O43435 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBX1O43435 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TBX1O43435 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBX1O43435 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBX1O43435 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBX1O43435 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBX1O43435 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBX1O43435 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBX1O43435 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TBX1O43435 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBX1O43435 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBX1O43435 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBX1O43435 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBX1O43435 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBX1O43435 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBX1O43435 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBX1O43435 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBX1O43435 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBX1O43435 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBX1O43435 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBX1O43435 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TBX1O43435 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBX1O43435 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBX1O43435 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBX1O43435 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBX1O43435 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TBX1O43435 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TBX1O43435 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TBX1O43435 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TBX1O43435 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBX1O43435 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBX1O43435 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBX1O43435 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBX1O43435 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TBX1O43435 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBX1O43435 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBX1O43435 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBX1O43435 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBX1O43435 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBX1O43435 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBX1O43435 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBX1O43435 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBX1O43435 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBX1O43435 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBX1O43435 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBX1O43435 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBX1O43435 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBX1O43435 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBX1O43435 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBX1O43435 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBX1O43435 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBX1O43435 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBX1O43435 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBX1O43435 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBX1O43435 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBX1O43435 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBX1O43435 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBX1O43435 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBX1O43435 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBX1O43435 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms