Protein–RNA interactions for Protein: O15265

ATXN7, Ataxin-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7O15265 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN7O15265 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7O15265 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms