Protein–RNA interactions for Protein: H7C1C5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1C5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1C5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1C5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1C5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1C5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1C5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1C5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1C5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1C5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1C5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1C5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1C5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1C5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1C5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1C5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1C5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1C5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1C5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1C5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1C5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1C5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1C5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1C5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1C5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1C5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1C5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1C5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1C5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1C5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1C5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1C5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1C5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1C5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1C5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1C5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1C5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1C5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1C5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1C5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1C5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1C5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1C5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1C5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1C5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1C5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1C5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1C5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1C5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1C5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1C5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1C5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1C5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1C5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1C5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1C5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1C5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1C5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1C5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1C5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1C5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1C5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1C5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1C5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1C5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1C5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1C5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1C5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1C5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1C5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1C5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1C5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1C5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1C5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1C5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1C5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1C5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1C5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1C5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1C5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1C5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C1C5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1C5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1C5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1C5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C1C5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1C5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1C5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1C5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1C5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C1C5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1C5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1C5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1C5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1C5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1C5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1C5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C1C5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1C5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1C5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C1C5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms