Protein–RNA interactions for Protein: G5E9R7

KRTAP4-16, HCG2042993, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-16G5E9R7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP4-16G5E9R7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP4-16G5E9R7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms