Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms