Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
STRCP1A6NGW2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
STRCP1A6NGW2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
STRCP1A6NGW2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
STRCP1A6NGW2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
STRCP1A6NGW2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
STRCP1A6NGW2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms