Protein–RNA interactions for Protein: A2VCK2

DCDC2B, Doublecortin domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2BA2VCK2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCDC2BA2VCK2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DCDC2BA2VCK2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCDC2BA2VCK2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCDC2BA2VCK2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DCDC2BA2VCK2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCDC2BA2VCK2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCDC2BA2VCK2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCDC2BA2VCK2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCDC2BA2VCK2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCDC2BA2VCK2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DCDC2BA2VCK2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCDC2BA2VCK2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCDC2BA2VCK2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCDC2BA2VCK2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCDC2BA2VCK2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCDC2BA2VCK2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCDC2BA2VCK2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCDC2BA2VCK2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCDC2BA2VCK2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DCDC2BA2VCK2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCDC2BA2VCK2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCDC2BA2VCK2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCDC2BA2VCK2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCDC2BA2VCK2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DCDC2BA2VCK2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCDC2BA2VCK2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCDC2BA2VCK2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms