Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTL3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTL3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1B0GTL3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GTL3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GTL3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GTL3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms