Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A4Q9UKG4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC13A4Q9UKG4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC13A4Q9UKG4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms