Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASIC3Q9UHC3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms