Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APEX2Q9UBZ4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APEX2Q9UBZ4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
APEX2Q9UBZ4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms