Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EHD4Q9H223 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
EHD4Q9H223 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EHD4Q9H223 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EHD4Q9H223 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EHD4Q9H223 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EHD4Q9H223 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EHD4Q9H223 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EHD4Q9H223 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EHD4Q9H223 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EHD4Q9H223 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EHD4Q9H223 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EHD4Q9H223 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EHD4Q9H223 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EHD4Q9H223 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EHD4Q9H223 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EHD4Q9H223 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EHD4Q9H223 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EHD4Q9H223 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
EHD4Q9H223 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EHD4Q9H223 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EHD4Q9H223 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EHD4Q9H223 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms