Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIL1Q9H173 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIL1Q9H173 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIL1Q9H173 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIL1Q9H173 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIL1Q9H173 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SIL1Q9H173 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIL1Q9H173 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIL1Q9H173 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIL1Q9H173 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIL1Q9H173 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIL1Q9H173 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIL1Q9H173 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIL1Q9H173 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIL1Q9H173 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIL1Q9H173 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIL1Q9H173 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIL1Q9H173 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIL1Q9H173 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIL1Q9H173 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SIL1Q9H173 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIL1Q9H173 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIL1Q9H173 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIL1Q9H173 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIL1Q9H173 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIL1Q9H173 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIL1Q9H173 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SIL1Q9H173 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SIL1Q9H173 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIL1Q9H173 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIL1Q9H173 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIL1Q9H173 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SIL1Q9H173 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SIL1Q9H173 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SIL1Q9H173 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SIL1Q9H173 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SIL1Q9H173 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms