Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP5Q9BXF6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP5Q9BXF6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms