Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSEN34Q9BSV6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSEN34Q9BSV6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSEN34Q9BSV6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TSEN34Q9BSV6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TSEN34Q9BSV6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TSEN34Q9BSV6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TSEN34Q9BSV6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TSEN34Q9BSV6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSEN34Q9BSV6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSEN34Q9BSV6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSEN34Q9BSV6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSEN34Q9BSV6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSEN34Q9BSV6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSEN34Q9BSV6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSEN34Q9BSV6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSEN34Q9BSV6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms