Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CNN2Q99439 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNN2Q99439 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms