Protein–RNA interactions for Protein: Q99418

CYTH2, Cytohesin-2, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH2Q99418 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH2Q99418 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH2Q99418 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH2Q99418 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH2Q99418 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH2Q99418 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH2Q99418 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH2Q99418 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH2Q99418 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH2Q99418 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH2Q99418 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH2Q99418 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH2Q99418 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH2Q99418 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH2Q99418 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH2Q99418 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH2Q99418 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH2Q99418 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH2Q99418 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH2Q99418 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYTH2Q99418 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYTH2Q99418 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYTH2Q99418 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH2Q99418 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms