Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUDCD1Q96RS6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms