Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPRD1AQ96P16 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPRD1AQ96P16 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms