Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF560Q96MR9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms