Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTERF3Q96E29 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTERF3Q96E29 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTERF3Q96E29 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.8 ms