Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO6Q96DC7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms