Protein–RNA interactions for Protein: Q92903

CDS1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDS1Q92903 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDS1Q92903 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDS1Q92903 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms