Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC9Q92623 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC9Q92623 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms