Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CARMIL3Q8ND23 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CARMIL3Q8ND23 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CARMIL3Q8ND23 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL3Q8ND23 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms