Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM87AQ8NBN3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM87AQ8NBN3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM87AQ8NBN3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms