Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTU1Q7Z7A3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTU1Q7Z7A3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms